Nella navata sinistra, in una nicchia, si trova il fonte battesimale, realizzato dagli artigiani della bottega di Santi Buglioli nel primo quarto del XVI secolo.
È in terracotta invetriata, di forma esagonale: nello scomparto frontale è rappresentato il Battesimo di Gesù, nel successivo, a destra, la predicazione di S. Giovanni, e quindi la Decollazione di Giovanni. 
A sinistra dello scomparto centrale è rappresentata la Benedizione di S. Giovannino da parte di San Zaccaria e di Santa Elisabetta, e nell’ultimo, San Giovannino fanciullo con la croce.